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华大基因-国家基因库系列后基因组时代鱼类样本库建设与实践孙颖石琼主编北京内容简介本书围绕鱼类样本库建设这个中心论点,回答为什么(鱼类种质资源保存和利用)、现状如何(国内外现状及现今的挑战和机遇)、怎样做(标准规范和最佳实践)、怎么用(配套数据库)等几个关键性问题,囊括鱼类样本库建设的几乎所有内容,阐述相关的生命伦理、质量控制、标准规范等重点论题,并且从鱼类样本的采集、处理、储存到基于样本的核酸提取、序列分析等均有详细的说明和指导,同时介绍鱼类样本库配套的生物信息数据库建设及模块化解决方案,让读者对鱼类样本库建设有一个全面而深入的认识。作为“华大基因-国家基因库系列”丛书中的一本,本书可作为深圳华大基因学院的研究生教材,也可供动物学、水生生物学、鱼类学有关专业的高年级本科生、研究生及从事生物样本库和信息数据库建设的相关学者参考使用。图书在版编目(CIP)数据后基因组时代鱼类样本库建设与实践/孙颖,石琼主编.—北京:科学出版社,2017.1(华大基因-国家基因库系列)ISBN978-7-03-051169-0I.①后….Ⅱ①孙…②石….Ⅲ①鱼类–基因组–信息–数据库.Ⅳ①Q959.403中国版本图书馆CIP数据核字(2016)第319172号责任编辑:夏梁/责任校对:郑金红责任印制:张伟/封面设计:刘新新出版北京东黄城根北街16号邮政编码:100717http://www.sciencep.com北京京华虎彩印刷有限公司印刷科学出版社发行各地新华书店经销*2017年1月第一版开本:787×10921/162017年1月第一次印刷印张:121/2字数:282000定价:88.00元(如有印装质量问题,我社负责调换)《后基因组时代鱼类样本库建设与实践》编委会主编孙颖石琼编委黄玉赵晓萌王敏徐跑徐军民刘凯徐钢春陈松林邵长伟徐东坡前言鱼类资源是全球生物资源的重要组成部分。据权威机构(世界鱼类数据库FishBase,又名鱼库)记载,全世界鱼类多达33100种,占所有脊椎动物种类数的一半以上。它们是最古老的脊椎动物,不仅物种数目庞大,多样性也极其丰富,体现在基因、表型、行为、生理生化等众多方面,是生物学家眼中炙手可热的研究对象。鱼类和人们的生活也密切相关,鱼肉是一种优质的动物蛋白,是日常生活中常见的餐桌美食,鱼粉、鱼油、鱼类活性蛋白这些添加剂、保健品、药品等也在人们生活中发挥着无法替代的巨大作用。2013年,生物样本库(biobank,又称生物银行)被美国《时代》杂志誉为“改变世界的十大规划”之一,近几年来受到各国政府、科研机构的广泛关注和高度重视,高水平、高质量的生物样本库是种质资源的保护中心,更成为疾病研究、药物研发、临床诊断等核心技术研究的宝贵资源。鱼类样本库建设早在19世纪就已开始,虽然当时“生物样本库”这一概念尚未明朗,但鱼类样本的收集、处理和保存工作已在全球各地展开。传统鱼类样本库建设以浸制标本为主,存在局限性,在这个基因测序技术、生物信息分析技术、大数据处理技术高速发展的后基因组时代,浸制标本无法满足提取高质量DNA和RNA的需求。因此,传统鱼类样本库纷纷向以低温和超低温技术为支撑的组学级别的鱼类样本库转型。超低温冰箱、干冰、液氮被用于长期保存或运输冻存样本,样本类型也从全鱼、骨架扩展到各部位组织、血液、细胞系、生殖细胞、肠道排泄物,以及提取的DNA、RNA、蛋白质等生物大分子物质,这些高质量样本能有效应用于基因组、宏基因组、转录组、蛋白质组的测序和分析,产生信息量巨大的组学“大数据”,并最终实现样本资源和数据资源的价值最大化,为鱼类基础研究、遗传多样性保护、种质资源的开发利用、疾病防控等众多领域提供强大支撑。随着基因组学技术的快速发展,越来越多的水生生物被用作全基因组测序的对象,相应生物学特性的分子机制被逐步揭示出来,而且部分数据已用于产业化应用(如分子育种、海洋药物研发等)。为了应对后基因组时代水生生物样本库的建设和发展问题,我们特别编写本书。以鱼类样本库的建设与实践为代表,我们期待为系统和科学地构建我国的水生生物基因库提供技术参考。本书围绕鱼类样本库建设这个中心论点,回答为什么(鱼类种质资源保存和利用)、现状如何(国内外现状及现今的挑战和机遇...

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